Plant Molecular Systematics Lab 

 

 

Sangtae Kim 김상태, Professor

Curriculum Vitae

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Magnoliaceae,

Lamiaceae,

Cyperaceae,

Basal angiosperms,

MADS-box genes

 

 

 

 

 

 

 

Graduate student Ph.D.

 Graduate student Ph.D.

Graduate student Ph.D.

Graduate student M. S.

Hyeon-Ji Moon

문현지

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Se-Eun Jung

정세은

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Jeong-Woo Seo

서정우

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Seung-Yeon Lee

이승연

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Phylogenetic study of chloroplast genome of Korean Viola

한국산 제비꽃속 엽록체 게놈 계통연구

Genome size estimation of Korean Viola

한국산 제비꽃속 유전체 크기 측정

An application of the DELTA: development of an interactive identification system for Korean Viola

델타 프로그램을 이용한 한국산 제비꽃속 대화형 검색시스템 개발

Automatic classification of Plant Herbarium Images Using Convolutional Neural Network

합성곱 신경망을 이용한 식물 표본 이미지의 자동 분류

Evolution of Carex based on intensive phylogenomic data

사초속 엽록체 유전자에 따른 진화 계통 분석

Investigation of the fruit morphological characters in Scutellaria (Lamiaceae)

전 세계 골무꽃속 식물 과실의 형태형질에 대한 연구

Evaluation of Scutellaria Hyp-seq data based on Sanger Sequencing of the best phylogenetically informative single-copy gene

최상의 계통적 정보를 갖는 단일 카피유전자의 Sanger sequecncing을 통한 골무꽃속 식물 Hyp-seq 자료의 검증

Determination of whole genome of Carex based on the Nanopore technologies

나노포어 기술을 이용한 사초속의 전체 유전체 결정

Graduate student M. S.

Graduate student M. S.

Undergraduate student-Integrated M.S.

Undergraduate student

 

Ji-Eun Lee

이지은

Button007_1.gif220226019 at sungshin.ac.kr

Yeon-Ju Son

손연주

Button007_1.gif220226018 at sungshin.ac.kr

Min-Gyung Jeong

정민경

Button007_1.gif20200409 at sungshin.ac.kr

Ye-Seul Kim

김예슬

Button007_1.gif20201152 at sungshin.ac.kr

Cp genome evolution in Cyperaceae and related families: focused on Juncaceae

사초과 엽록체 유전체의 진화 연구: 골풀과를 중점으로

Spiraea

조팝나무속

An application of the DELTA: development of an interactive identification system for Korean Carex of Molliculae-Castanea Clade

DELTA의 활용: Molliculae-Castancea 분계조에 속하는 한국산 사초속 식물의 대화형 검색 시스템 개발

Measurement of the genome size for plant species in the genus Pseudolysimachion in Korea using Flow cytometry

Flow cytometry를 이용한 한국산 꼬리풀속 식물 수 종에 대한 유전체 양 측정

Undergraduate student

Undergraduate student

 

 

   

Bo-Ra Eun

은보라

Button007_1.gif20201177 at sungshin.ac.kr

Ji-Ye Suh

서지예

Button007_1.gif20211259 at sungshin.ac.kr    

   

한국산 독활과 땅두릅의 분류학적 재검토

Taxonomic revision of Aralia cordata and Aralia continentalis distributed in Korea

Determination MicroRNA of Carex

사초속 MicroRNA 연구

 

 

 

 

 

 

ALUMNAI

Graduate

Yunju Ma, M.S. Aug., 2011.  Taxonomic study of Isodon (Schrad. ex Benth.) Spach (Lamiaceae) in Korea

Eunji Song, M.S. Aug., 2012.  Phylogeny of subgenus Yulania (Magnoliaceae) and relat ed taxa based on chloroplast genomes.

Sungmin Kim, Ph.D. Aug., 2012.  Classification and phylogeny of Juncus

Miri Lee, M.S. Aug., 2013.  Phylogeny of B-class MADS-box genes in Lamiaceae

Jongduk Jung, PostDoc. 2013~2014.

Jieun Park, M.S.  Aug., 2018. Expression of floral MADS-box-genes in Nymphaea based on transcriptiome analyses

Suhyeon Park, Ph.D., 2020. Phylogeny and evlution of Magnoliaceae  

Bora Lee, Ph.D., 2021. Phylogeny of Carex. MADS-box gene evolution in Carex

Younkyong Lee, Ph.D., 2021. Phylogeny of Scutellaria (Lamiaceae)

 

 

학부연구생 , 연구실 인턴, UROP program, 생명과학특수연구/생명과학창의설계 이수자

2009 신수경

2010 김수진

2011 임정은 이경진

2012 이은혜 이정은

2013 이윤경 박수현

2014 구본희 김주현

2015 김혜린

2016 문현지

2017 석경서

2019 이예은 김시안

2020 서정우 이승연 박보현 서지은

2021 이지은 강명보 유승진 정민경

2022 김예슬 한수경 은보라 서지예

 

UROP program

2023 겨울방학  은보라. 한국산 독활과 땅두릅의 분류학적 재검토

2022 여름방학  한수경. 성신여대 표본관의 한국산 Artemisia(쑥속) 식물의 재동정 
                          김예슬. Flow cytometry를 이용한 한국산 꼬리풀속 식물 수 종의 유전체 양 측정

2022 겨울방학  서지은. 콜롬비아 멸종위기 목련 두 종(Magnolia yarumalensisMagnolia guatapensis)의 엽록체 유전체 결정을 위한 annotation 및 Genbank submission 연구
                          정민경. 한국산 사초속  Molliculae-Castanea 분계조의 화분학적 연구

2021 여름방학  강명보. Development of High Molecular Weight Plant DNA Extraction for Genome studies
                          이지은. Structural polymorphism of chloroplast genomic in
Carex paxii

2021 겨울방학  서지은. NGS data에 의한 황해쑥(Artemisia argyi Leveille et Vaniot) 엽록체 유전체 결정
                          이승연. Nanopore 기술을 이용한 도깨비사초(
Carex dickinsii Franch.&Sav.)의 염기서열 결정

2021 여름방학  이예은. 왜제비꽃(Viola japonica Langsd.)의 엽록체 유전체 염기서열 결정
                          여윤주. 콩제비꽃의 엽록체 유전체 결정

2020 겨울방학  이예은. 유세포 분석기를 이용한 멸종위기종 식물의 유전체양 측정

 

 

 

생명과학특수연구/생명과학창의설계

2022년 2학기  김예슬. Estimation of genome size in Korean Pseudolysimachion and their morpholgy
                         한수경. A morphological study of Artemisia based on specimen in the herbarium of Sungshin Women's University

2022년 1학기  강명보. Bibliographic review: recent advances in plant fossil DNA studies
                         서지은. Determination of chloroplast genome sequence of
Magnolia yarumalensis (Lozano) Govaerts
                                    & Phylogeny of B-class MADS-box genes in Magnoliaceae based on NGS data
                         정민경. Development of an interactive identification system for Korean
Carex: focused on the vegitative organs

2021년 2학기  강명보. A suggestion of the standard protocol for high molecular weight DNA extraction in plant genomic studies
                         이지은. Determination of a complex-structured chloroplast genomes in selected Korean
Carex taxa based on the Nanopore technology
                         정민경. 한국산 사초속 흰사초절 식물의 분류학적 연구

2021년 1학기  서정우. Evaluation of Scutellaria Hyp-Seq data based on Sanger Sequencing of the best phylogenetically informative single-copy gene
                         이승연. Determination of
Carexbreviculmis R. Br. genome based on the Oxford Nanopore Technology
                         이지은. Determination of chloroplast genome sequence of
Juncus fauriei H. Lev. & Vaniot (Juncaceae)

2020년 1학기  여윤주. Magnolia ofeliae Vazquez(Magnoliaceae)의 엽록체 유전체 결정

2019년 2학기  이예은. 한국산 꼬리풀속 식물의 계통학적 연구를 위한 DNA 염기서열 기초 자료 분석

2019년 1학기  이예은. Estimation of Genome Size in Angiosperms Distributed in Korea Based on Flow Cytometry

2017년 1학기  석경서. 멸종위기 종 선모시대(Adenophora erecta)의 유전다양성 연구

2016년 2학기  문현지. A mathematical study on better error-correction codes for index sequence in the NGS
                         이하연. 성신여대 표본관 (SWU) 소장 미나리아재비과 표본 조사 연구

2015년 2학기  김혜린. 목련과 내 MICHELIA 그룹 식물들의 DNA-Barcode System 개발

2014년 2학기  김주현. Detection of floral MADS-box genes in Cyperaceae
                         동지영. Phylogenetic position of several Korean sedges

2014년 1학기  구본희. Domestication history of rice based on massive chloroplast genome data

2013년 1학기  이윤경. 성신여대 표본관 (SWU) 소장 꿀풀과 표본 조사 연구; Investigaion of Lamiaceae Sheets in the SWU Herbarium
                         이정은. Phylogeny of
Carex (Cyperaceae) using multiple DNA region: focused on Korean species

2012년 1학기  박수현. 성신여대 표본관 (SWU) 사초속 (방동사니과) 식물표본 조사연구; A survey of Carex (Cyperaceae) specimen in SWU

2011년 2학기  이정은. Phylogeny of Carex (Cyperaceae) based on chloroplast matK regions : focused on Korean taxa

2010년 2학기  이유정. Development of Morphological Interactive Key in Korean Lamiaceae

 

 

 

바이오데이터 엔지니어 참여자

2021 문현지, 심예진, 정세은, 김규리, 김희지

 

updated: Feb. 2023

 

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